一，潜伏感染。一些微生物引起的尿道炎用抗生素后，由于药物和治疗的缺陷，细菌会进入潜伏感染状态。饮酒、疲劳、精神紧张等因素都可能诱发潜伏的致病菌繁殖，从而引起尿道炎症状复发。

 

　　二，深部的感染。由于致病菌隐藏在深层组织，以及尿道隐窝、尿道旁腺等部位，药物很难将其杀灭，留下后患。同时，急性尿道炎可能伴有前列腺炎，尿道炎治疗时可能因前列腺感染而复发。

 

　　三，病原菌对药物有耐药性。由于发病初期治疗不规范，盲目用药，破坏了内环境，且细菌产生耐药性，时好时坏，导致持续性尿道炎。

 

　　四，原因是患者接受性伴侣治疗后症状持续或症状消失后复发。可能的是，性伴侣没有得到治疗。未经治疗与性伴侣性交，病菌通过未经治疗的性伴侣再次传染给患者。

 

　　五，自身免疫力低。同时，部分患者免疫力较低，如糖尿病、肝病、营养不良或其他慢性疾病，也给尿道炎的治疗造成了很多困难。